Charles Leclerc ha dominato la seconda sessione di prove libere, rifilando oltre 6 decimi al suo compagno di team Sebastian Vettel e oltre 8 decimi alla Mercedes di Bottas. Le Ferrari si dimostrano, almeno dalle prove del venerdi, di essere le vetture di riferimento su questo tracciato, che ben si sposa con le caratteristiche tecniche della SF90.
Anche con una Power Unit potenziata, le Mercedes si devono accontentare della terza e quarta posizione, con Bottas davanti ad Hamilton e staccati rispettivamente di 8 e 9 decimi da Leclerc.
Una delle star della sessione è stata Sergio Perez della Racing Point. Il pilota messicano è arrivato quinto a Spa tre volte nelle ultime quattro stagioni, ed è stato quel posto che ha occupato alla fine della FP2, a meno di un secondo di distanza dalla Ferrari e davanti a entrambe le Red Bull.
Per il messicano momenti di paura negli ultimi istanti della sessione con la sua RP19 a fiamme a bordo pista.
Dietro Perez troviamo Max Verstappen, il più veloce della Red Bull, in sesta posizione, mentre Albon non va oltre alla decima posizione.
Raikkonen su Alfa Romeo chiude in settima piazza, nonostante un problema fisico alla gamba, mentre Stroll dimostra che il ritmo del suo compagno di squadra non è stato un semplice colpo di fortuna e finisce ottao, davanti a Ricciardo su Renault.