Le qualifiche del Gran Premio di Misano si chiudono con un finale esplosivo: Marco Bezzecchi conquista la pole position con un tempo straordinario di 1:30.134, al termine di una Q2 infuocata e ricca di sorprese. L’unico italiano a non accedere alle Q2 è Enea Bastianini, protagonista sfortunato della giornata: dopo un’ottima prestazione iniziale nelle Q1, cade e, nonostante riesca a rientrare in pista, non trova il tempo necessario per proseguire. A strappare il pass per la Q2 sono invece Fermín Aldeguer, sempre più convincente sulla sua Ducati, e Fabio Quartararo, perfetto nella gestione della sua Yamaha.
Nella Q2 è Quartararo il primo a scendere in pista con due gomme soft nuove. Il duello iniziale è tra i fratelli Marc e Alex Márquez, con Marc che guida il gruppo nel primo stint, seguito da un brillante Morbidelli a soli due decimi e mezzo. Bezzecchi, dopo una partenza prudente, entra nella lotta con Acosta, mentre Marc Márquez commette un errore e rallenta, favorendo il miglior tempo temporaneo del fratello Alex.
Marc torna ai box per discutere la strategia con i tecnici, mentre gli altri piloti sfruttano la pista libera. Quartararo accusa la fatica delle Q1 e ottiene solo l’ottavo tempo iniziale. La strategia di Marc di anticipare il cambio gomme si rivela astuta, mentre Bagnaia tenta il colpo da solo ma sbaglia in fase di cambio direzione, venendo raggiunto da Aldeguer. Anche la coppia Bezzecchi–Martin e i fratelli Márquez tornano in pista per gli ultimi attacchi al cronometro. Acosta scivola proprio quando stava migliorando, mentre Marc Márquez segna un ottimo giro ma non sufficiente per scalzare Alex dalla vetta.
Negli ultimi venti secondi, è ancora Bezzecchi a prendersi la scena con un giro perfetto che vale la pole position. A chiudere la top 3 troviamo Alex Márquez, secondo, e uno scatenato Quartararo in terza posizione. Subito dietro Marc Márquez (4°), Morbidelli (5°) e Marini (6°), tutti racchiusi in pochi decimi.
Una qualifica tiratissima, con Bezzecchi che si prende la scena nel momento decisivo.